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Linux

生物資訊軟體安裝筆記 (Linux)

By snese ⋅ June 15, 2007 ⋅ Post a comment

在安裝這些軟體的同時，我有做些簡單安裝的紀錄，一方面可以節省以後要重裝的時間，另一方面也讓老師知道我到底在搞什麼東東。

目前寫好的安裝筆記有〈BioPerl、BLAST、Clustalw、EMBOSS、GENSCAN、mfold、Primer3、RNAz、tRNAscan、Vienna RNA Package、WU-BLAST〉之後還陸續會有 RepeatMasker、Phrap 等。

主要的安裝環境為 Fedora Core 6 ，基本上其他平台應該也是適用才對，當然有些利用 rpm 的偷吃步例外，無論如何希望這些簡單的筆記能幫助有需要的人。

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Discussion

4 comments for “生物資訊軟體安裝筆記 (Linux)”

  1. 我想請問一下,我照您的安裝步驟安裝了BLAST,可是安裝了我不會用耶
    請問有沒有相關的資料讓我看呢???

    Posted by 才剛學生物資訊的大學生No Gravatar | July 19, 2007, 9:22 am

  2. 安裝完後，可以先參考看看他所附上的 doc 資料，上面都有簡略的介紹 :D

    要是這樣還是不會用的話，再把問題寫出來大家一起研究看看吧！

    Posted by sneseNo Gravatar | July 20, 2007, 8:24 am

  3. 我已經安裝好Pｒｉｍｅｒ３了
    但是不知如何放入單一序列找ｐｒｉｍｅｒ
    請問語法為何？　請版主指教　＞”＜

    Posted by 生物資訊快被當。。。No Gravatar | December 8, 2008, 6:09 pm

  4. 標準的 Input 是
    $ primer3_core < my_input_file

    這樣就應該會用了吧？更多的用法，可以用 man 去查。

    Posted by sneseNo Gravatar | December 8, 2008, 11:39 pm

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